Virology Journal, 2005; 2: 19-19 (más artículos en esta revista)

Bacteriófagos: Los virus para todas las estaciones de la biología molecular

BioMed Central
Jim D Karam (karam@tulane.edu) [1]
[1] Departamento de Bioquímica, Ciencias de la Salud de la Universidad de Tulane Center, de Nueva Orleans, Louisiana, EE.UU.

Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0], que permite el uso irrestricto, la distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que la obra original sea debidamente citada.

Resumen

Bacteriófago continúa la investigación para abrir nuevos caminos en nuestra comprensión de los mecanismos moleculares básicos de la acción de genes y estructura biológica. La abundancia de bacteriófagos en la naturaleza y la diversidad de sus genomas son dos razones por fagos investigación rebosa de emoción. Las páginas de Virología Diario reflejará la emoción de la "Nueva Phage Biología".

El lanzamiento de Virología Diario llega en un momento de resurgimiento del interés en la biología básica de los bacteriófagos y el impacto que tienen estos virus en la tierra de la ecología, la evolución de la diversidad microbiana y el control de las enfermedades infecciosas. Desde desempeña un importante papel en el nacimiento de la Biología Molecular hace más de 50 años [1], fagos investigación ha abierto nuevos caminos en nuestra comprensión de los mecanismos moleculares básicos de la acción de genes y estructura biológica [2]. Esta tendencia no muestra signos de debilitamiento. En una reciente reunión internacional titulado La Nueva Phage Biología [3], el programa fue dedicado en gran parte a las nuevas fronteras de la investigación que han sido habilitados por una rápida acumulación de información de secuencia del genoma de una amplia variedad de bacteriófagos. Fagos genómica está revelando nuevos mecanismos bioquímicos para la reproducción, el mantenimiento y la expresión del material genético y aporta nuevos conocimientos sobre los orígenes de las enfermedades infecciosas y el uso potencial de los productos de genes de fagos, e incluso toda la fagos como agentes terapéuticos.

Dos razones por las que la nueva era de fagos con emoción rebosa de investigación son la abundancia de bacteriófagos en la naturaleza y la diversidad de sus genomas. Fagos es probablemente el más ampliamente distribuido entidad biológica en la biosfera, con una población estimada de> 10 30 o ~ 10 millones por centímetro cúbico de cualquier nicho ambiental donde residen las bacterias o arqueas [4]. Por un lado, hay diversidad en los tipos de fagos que infectan individuales o interrelacionados especies bacterianas. En otro plano, hay diversidad entre genomically relacionados con fagos que no comparten el mismo bacteriana anfitriones. Un ejemplo es el líticas Enterobacterial dsADN fago T4, que tiene parientes que son específicos de Aeromonas, Vibrio, Acinetobacter, marinas y otras especies bacterianas. Los genomas de algunos fagos T4-como se han secuenciado y se encontró que efectivamente comparten homología con T4, pero que también difieren entre sí en tamaño, la organización de la T4-al igual que los genes y el contenido de otros genes y el ADN putativo elementos móviles (http : / / Phage.bioc.tulane.edu]. Parece que las familias, como el fago T4 relacionados con fagos han aprendido a cruzar barreras entre especies bacterianas y poseer los genomas de plástico que pueden adquirir y perder casetes genéticos a través de sus viajes por el mundo microbiano. En esencia, los genomas de fagos dsADN pueden ser depositarios de la diversidad genética de los microorganismos en la naturaleza.

Además de la evolución de los traficantes en calidad microbiana de los genes, genomas de fagos evolucionan a través de la acumulación de mutaciones en ambos genes adquiridos y básico. Secuencia de divergencia entre los homólogos de los genes esenciales para la propagación dentro de un fago fago familia puede ser utilizada como una fuente de información sobre los factores determinantes de la especificidad de la proteína-proteína y proteína-ácido nucleico de las interacciones que subyacen en función biológica. Fagos son fuentes excelentes de muchas enzimas y bioquímica de las transacciones que están ampliamente representados en todas las divisiones de la vida. El gran número de variantes filogenéticas biológicamente interesante de proteínas y ácidos nucleicos que se puede derivar de la secuencia de genomas de fagos son troves del tesoro para el estudio de la estructura biológica en relación con la función. El interés en fagos y fagos productos genéticos como posibles agentes terapéuticos también está aumentando rápidamente y es probable que tenga repercusiones en la industria farmacéutica y la biotecnología en general en los próximos años. Hay una sensación general de que lo mejor está por salir de fagos investigación.

Conclusión

Esperamos que las páginas de Virología Diario reflejará la emoción de la "Nueva Biología Phage" por la publicación de informes en las áreas de Ecología y Taxonomía, Genómica y Molecular Evolution, el Reglamento de la Expresión Génica, la replicación del genoma y Mantenimiento, de proteínas y ácidos nucleicos Estructura, el virus de la concentración, la Biotecnología, Patogénesis, Terapéutica y más. Sería especialmente interesante para ver las presentaciones de la secuencia del genoma del fago escritos y sus implicaciones biológicas.

Conflicto de intereses

Los autores declaran que no tienen intereses en conflicto.