BioMedical Engineering OnLine, 2005; 4: 26-26 (más artículos en esta revista)

Examen sobre "Computación de Altas Prestaciones de la Ciencia y de Ingeniería, Munich 2004" editado por S. Wagner, W. Hanke, A. y F. Bode Durst

BioMed Central
Kurt Saetzler (k.saetzler @ ulster.ac.uk) [1]
[1] Grupo de Investigación en Bioinformática de la Facultad de Ciencias Biomédicas de la Universidad de Ulster, Coleraine, Co Londonderry, BT52 1SA, Irlanda del Norte, Reino Unido

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El carácter general del título del libro plantea muchas expectativas con respecto a la computación de alto rendimiento (HPC). Una de ellas es la tentación de creer que este libro se examinan en mayor detalle las diferentes arquitecturas HPC, sus ventajas y desventajas, muestra diferentes estrategias de aplicación para hacer uso de la enorme potencia que ofrecen estas arquitecturas, las listas de paquetes de software y ayudar a las bibliotecas en parallelizing código, da Consejos para la evaluación comparativa, habla de compilador cuestiones, el procesamiento por lotes, las direcciones de memoria compartida y distribuida modelos y los gastos generales asociados con la comunicación entre procesos. El resumen de la contraportada del libro, el que se establece que los autores de los "de vanguardia grupos de investigación en el campo de la computación científica, presentar sus proyectos pendientes" y "describir sus antecedentes científicos, sus necesidades de recursos con respecto a los de nivel superior superordenadores , Y sus métodos para la utilización eficiente de la costosa de alto rendimiento de energía "sólo se suma a esa expectativa.

Desembalar el libro antes de su laminación revela que se debería haber prestado más atención a la parte 'Munich de 2004 "en el título. Leer las primeras páginas del libro y el prefacio indica que el libro es una colección de informes de situación seleccionados que se presentaron en un taller en Munich en la 2 ª y 3 ª de marzo de 2004. Los participantes del taller fueron todos los miembros de la Red para la Competencia de Técnico / científico de computación de alto rendimiento (KONWIHR) trabajan en estrecha colaboración con el Centro de Computación de Altas Prestaciones en Baviera (HLRB). Aunque los editores hincapié en la colaboración internacional en curso de varios grupos de investigación dentro de la red, el marco elegido para el libro reduce drásticamente la opinión de HPC a la KONWIHR perspectiva. Parece que la publicación de un libro oficial Springer era mucho más atractiva para los editores de que sólo la presentación de un informe técnico interno de los patrocinadores de KONWIHR, como la Fundación Alemana para la Investigación (DFG) y el Estado de Baviera Ministerio de Ciencia, Investigación y Arte.

Lamentablemente, los editores no hacer un mayor esfuerzo para hacer de este un libro que se centra en HPC. Los artículos presentados al lector son muy variables en calidad y sólo una minoría cumple con las expectativas planteadas en HPC. Algunos de los artículos no se hayan corregido a fondo y todavía contienen muchos errores escribiendo. Algunos las leyendas de las figuras no fueron traducidos al Inglés. La motivación para el uso de HPC pobres y, a menudo, se da como necesidad de velocidad, pero la ganancia en velocidad rara vez se detallan. Lo que es más importante, la gran mayoría de los artículos se centran en aplicaciones muy específicas, que requieren un grado de conocimiento en ese campo particular. Como las tapas de libros "y la elaboración de modelos de simulación en las disciplinas Biológicas, Química, Química Física, Física del Estado Sólido-, de alta energía Física, Astrofísica, Geofísica, Dinámica de los Fluidos Computacional, y Ciencias de la Computación" es imposible entender a cada uno de los artículos más Detalle. Y, por último, si bien el número de disciplinas que abarca es amplia, el libro no da una visión general sobre la investigación HPC buscando en cada disciplina por separado, lo que es particularmente cierto para las Biociencias.

Personalmente, creo que el título del libro debería haber sido escogida con más cuidado que refleja claramente la naturaleza de este libro. Como muchos de los artículos presentados parecen ser en parte publicado en otra parte, una versión electrónica de la recopilación de informes habría sido una forma más eficiente en la difusión de los resultados de la KONWIHR proyecto. Esto habría tenido la ventaja adicional de que los artículos que se podrían haber buscado un electrónicamente palabras clave específicas. El libro es, en efecto, no es adecuada para alguien en general, interesados en HPC, pero podría ser un buen punto de referencia para alguien trabajando en un proyecto muy similar a la que los incluidos en los artículos.