PLoS Biology, 2005; 3(5): (más artículos en esta revista)

Epigenome red de excelencia

Biblioteca Pública de la Ciencia
Asifa Akhtar, Giacomo Cavalli
Resumen

Una iniciativa financiada por la Unión Europea es la creación de una red de colaboración establecido y jóvenes de los grupos de investigación para hacer frente a cuestiones clave en la epigenética.

El término "epigenética" fue propuesta por primera vez por Conrad Waddington para designar el estudio de los procesos por los cuales la información genética de un organismo, que se define como el genotipo, interactúa con el medio ambiente a fin de producir sus rasgos observados, que se define como fenotipo [1]. Más recientemente, el término ha sido utilizado para describir los cambios hereditarios en la función del genoma que se producen sin un cambio en la secuencia de ADN [2]. Estas dos definiciones están más cerca de lo que parecen. En las células eucariotas, el ADN genómico es empaquetado por histonas y no histonas proteínas en una dinámica de polímeros define como la cromatina. Varias enzimas pueden modificar la estructura y la composición de la cromatina, tanto a nivel local como a nivel mundial, y que pueden dirigir la herencia de las estructuras locales de la cromatina a través de la división celular [3, 4]. Por lo tanto, las células de un individuo todos comparten la misma secuencia lineal de nucleótidos de ADN del genoma de diferentes tipos de células, pero se caracterizan por la presencia de diferentes sabores de la cromatina este genoma de la epigenomes-que especifican las funciones de la característica de cada tipo celular y permitir que la Mantenimiento de la memoria de estas funciones a través de la división celular. De hecho, un gran conjunto de los procesos de regulación del genoma epigenéticos determinación y la participación de la herencia.

Debido a la gran complejidad de la regulación epigenética, que van desde los genes individuales a todo el plegamiento de los cromosomas en el núcleo, la epigenética supone una increíblemente amplia gama de técnicas y enfoques. Estos implican estructural, molecular y la biología del desarrollo, de imagen avanzadas, la genómica, la proteómica, bioinformática, y análisis matemático. Epigenéticas de la investigación se aplica a los diferentes organismos, y que a menudo incluye el análisis comparativo desde una perspectiva evolutiva. Los investigadores en este ámbito por lo tanto, debe cruzar las fronteras entre las distintas áreas de investigación a fin de comprender el impacto de los nuevos hallazgos. Esto hace que la epigenética muy dinámico ámbito de la investigación, que al mismo tiempo ofrece un terreno ideal para la colaboración y la interacción sinérgica.

Con el apoyo del Sexto Programa Marco de la Unión Europea, un consorcio de 25 laboratorios principales y 26 laboratorios asociados Epigenome inició la Red de Excelencia (RE) en el año 2004. Esta red va a abordar cuestiones clave en la investigación epigenética, jóvenes integrar equipos de investigación en Europa, proporcionará a la comunidad científica con una amplia gama de recursos, incluidos los basados en la Web la información, y difundir los conocimientos científicos a los científicos, estudiantes y el público en general. Epigenome NoE coordinador, Thomas Jenuwein, dice "epigenéticas de la investigación representa una de las nuevas fronteras de la biología moderna con un impacto considerable en muchos mecanismos básicos y de la biología humana y la enfermedad. Con este RE, la Comisión Europea ha permitido a los afiliados miembros de la red para establecer un marco coherente para la promoción de este apasionante campo de investigación también a los no miembros y a los colegas interesados fuera del campo. Estoy convencido de que el espíritu entusiasta del kick-off meeting en la Abadía de Mendel en Brno (septiembre de 2004) ha inspirado a muchos y de larga duración para las señales de una red de integración funcional y de toda Europa. "

Epigenome NoE tiene cuatro objetivos principales. La primera consiste en promover los descubrimientos científicos a través de un fuerte programa conjunto de actividades, de los cuales una gran parte se dedica a la investigación llevada a cabo por miembros de los laboratorios, solo o en colaboración. Estos proyectos van desde la modificación de la cromatina de células suerte y las enfermedades y atender algunas de las "grandes cuestiones" en la investigación epigenética (Figura 1].

El segundo objetivo es integrar a los jóvenes investigadores en la red a través de un programa denominado Nuevos Equipos de fundación (NET). NET proporciona fondos para la investigación y la integración en el programa de actividades conjuntas a prometedores jóvenes investigadores. Recientemente establecido los investigadores a menudo lucha por adquirir laboratorio de la financiación, establecer colaboraciones, o simplemente recabar información sobre los recursos disponibles en el campo. NET El programa proporciona una plataforma ideal para esos investigadores de la generación de un ambiente de colaboración y oportunidades para la creación de proyectos conjuntos y la obtención de nivel superior reactivos de bioquímica y genómica, así como el acceso al uso de las más modernas instalaciones de genómica y proteómica. El más establecido NoE miembros también actúan como tutores de los participantes NET. En una primera ola de la integración, doce NET investigadores fueron seleccionados por un comité consultivo (compuesto por siete científicos de Estados Unidos, que son líderes mundiales en investigación epigenética) y participó en la sesión inaugural. Una segunda llamada a la integración de otros diez miembros NET se pondrá en marcha en 2006, anunciado a finales de este año a través del sitio Web de Epigenome NoE ( Http://www.epigenome-noe.net ). La presente convocatoria se completará el programa NET para los cinco años de duración de este periodo de financiación NoE. De tener éxito, este tipo de esfuerzo integrado puede servir como ejemplo para las futuras a gran escala de proyectos de colaboración. La red se está preparando para mantener su financiación a más largo plazo, a fin de que pueda seguir atrayendo a las generaciones futuras de nivel superior de los jóvenes científicos europeos a la epigenética. Jacques Remacle, Comisión de la UE Oficial de la Ciencia, dice: "A fin de fomentar el progreso de la investigación en la epigenética, la Epigenome NoE tendrá que mantener una estructura dinámica que involucre también a la participación e integración de equipos de investigación de reciente creación. Por su carácter flexible, la Red de Excelencia instrumento permite a los consorcios a evolucionar con el tiempo para satisfacer los nuevos retos a la investigación y / o para promover la apertura, de expansión y durabilidad. El nuevo NET 12 [investigadores] que se están sumando a la Epigenome NoE tras una convocatoria abierta (57 solicitudes) y de un transparente proceso de selección son de calidad excepcional. Estoy firmemente convencido de que su participación e integración a la Epigenome NoE proyecto beneficiará a la investigación epigenética en Europa. A raíz de este ejemplo exitoso, el concepto de convocatoria abierta para los jóvenes investigadores es ahora promovida por varias redes de excelencia en otras áreas de investigación. "

Un tercer objetivo de la red es facilitar a la comunidad científica con un gran conjunto de los recursos y la información en la investigación epigenética, y para centralizar el acceso a la información ya disponible de las fuentes existentes. La clave de este objetivo es la Epigenome NoE sitio Web ( Http://www.epigenome-noe.net ). Durante el año 2005, el sitio crezca en su papel de una base de datos de la tecnología y los recursos disponibles en los distintos laboratorios y de las instituciones. Cualquier científico externo a la red tendrán la oportunidad de establecer colaboraciones con los miembros de RE y, por tanto, el acceso a estos recursos. Además, el sitio Web se incrementará con bases de datos de los protocolos experimentales, laboratorios, y las conferencias y cursos. Interactive Web foros para la discusión de cada uno de los recursos y otros temas candentes en el ámbito de la epigenética se abrió, y las oportunidades de empleo se publicarán periódicamente. Este sitio Web es, por lo tanto, está previsto que se convierta en una importante fuente de información para los investigadores epigenéticos.

Un cuarto objetivo de la Epigenome NoE es tener anual de reuniones y talleres que se organizan en torno a temas específicos de investigación, que fomentará la colaboración que puedan ser tan importante, si no más importante, que la iniciativa de financiación propia. La NoE también tiene por objeto llegar a la más amplia comunidad científica y el público, con lo que el concepto y la importancia de la epigenética a su atención, y aumentar la conciencia pública respecto de los principales efectos de la investigación epigenética en áreas importantes como la agricultura y la medicina. Esto se logrará mediante la organización de eventos científicos público, mediante la publicación de material escrito en un lenguaje que sentar exámenes específicos de los temas de interés particular, mediante la creación de un servicio de información en la web de la epigenética y la genómica, y por el mantenimiento de una actualización "Preguntas más frecuentes" sitio Web. Una educación de la página ya está publicado, que contiene una gran colección de la web material de enseñanza sobre cuestiones relacionadas con la epigenética. Los materiales educativos elaborados en casa será añadido aquí en el futuro. El componente público en la ciencia en este NoE nos permitirán comunicar tanto la belleza de las cuestiones científicas, así como la importante relevancia médica y ética de la epigenética para el público en general, por lo tanto, salvar una brecha entre los científicos y la sociedad. Genética es cada vez profundamente arraigada en la fundaciones culturales de las sociedades modernas. La epigenética es igualmente importante, y gracias a las actividades de la Epigenome NoE, esta relativamente nueva rama de la ciencia pronto podría convertirse en familiar para un público mucho más amplio.

Los autores desean agradecer a S. E. Webb Grünert y de discusión crítica, durante la preparación del manuscrito.