PLoS Computational Biology, 2005; 1(1): (más artículos en esta revista)

PLoS biología computacional: una nueva comunidad Diario

Philip E Bourne, Steven E Brenner, Michael Eisen B

Bienvenido a PLoS Computational Biology, una comunidad revista de la Biblioteca Pública de la Ciencia dedicada a la presentación de informes biológicos avances logrados a través de la computación. La revista se publica en colaboración con la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). La importancia de esta asociación se describe en la carta de acompañamiento de Michael Gribskov, ISCB presidente.

¿Qué nos motiva a iniciar una nueva publicación en este momento? Computación, impulsada en parte por la afluencia de grandes cantidades de datos biológicos en todas las escalas, se ha convertido en una de las características principales de la investigación y el descubrimiento en las ciencias de la vida. Este trabajo tiende a ser publicados ya sea en los métodos de las revistas que no son leídos por los experimentadores o en una de las numerosas revistas de biología novela de la presentación de informes, cada uno de los que publica sólo una pequeña cantidad de la investigación computacional. Por lo tanto, el impacto de esta investigación se diluye. PLoS Computational Biology proporciona un hogar para la investigación biológica importante impulsada por el cómputo de un lugar donde los biólogos computacionales puede encontrar el mejor trabajo realizado por sus colegas, y donde la más amplia comunidad biológica puede ver la infinidad de maneras Cómputo avanza nuestra comprensión de los sistemas biológicos.

PLoS Biología Computacional se rige por un principio general: la calidad científica. Esta calidad se refleja en el consejo editorial y la redacción. El editorial miembros de la junta son líderes en sus respectivas áreas de las ciencias y se han puesto de acuerdo para dar su valioso tiempo para apoyar una revista de calidad en su campo. Detrás de las escenas, a través de un riguroso proceso de presubmission, tres exámenes de calidad para cada documento, y una tasa de aceptación por debajo del 20%, los editores y el personal ya conocía en los seis meses desde que se lanzó la revista de que estábamos produciendo un producto de primera calidad. El contenido científico está ahora aquí de todos ustedes para ver y continuará construyendo en los meses y años por venir.

Biología computacional se nutre de abrir el acceso a los datos biológicos.

La edición inaugural de PLoS Computational Biology incluye una perspectiva de Sean Eddy en su convicción de que estamos en la "previa"-disciplinaria etapa de nuestra ciencia-un momento antes de convertirse en una ciencia organizada y no debe confundirse con el impulso hacia el ser " Entre "-disciplinaria, ya que muchos se han convertido en nosotros. Perspectivas, y, más tarde, comentarios, será un elemento habitual de la revista. Esto es seguido por una serie de artículos de investigación, incluyendo una sinopsis de cada distinta de la científica resumen, escrito por los autores para nonexperts. Entre estos artículos, Pagel et al. Presentamos un método para la determinación de pares de genes relacionados funcionalmente y luego usar ese método para estudiar la forma en que estos pares son o bien ganado o perdido durante la evolución en el tiempo; Margalit et al. Informe sobre el modelado de factor de transcripción y la unión de descubrir esos 29 sitios de unión para C2H2 zinc-dedo proteínas en Drosophila melanogaster, y Ehrenberg et al. Modelo ribosome-transcripcional mediada atenuación y explicar las diferencias funcionales que resultan de las diferencias estructurales de las secuencias líder de la trp y su operones.

La visión que tenemos para PLoS Computational Biology revista como una comunidad es en primer lugar el apoyo a la difusión de nuestra ciencia de una manera que llama la atención a la calidad, profundidad y alcance de nuestros mejores trabajos. Que se trata de una revista de acceso abierto es una parte integral de esta visión. Acceso abierto no sólo asegura que todo lo que se publique de inmediato a la libre disposición de cualquiera, en cualquier parte del mundo, sino también que el contenido de esta revista pueden ser distribuidos, y reutilizados de manera que aumenten su valor. Biología computacional se nutre de abrir el acceso a las secuencias de ADN, proteínas estructuras, y otros tipos de datos biológicos-ya es hora de que apliquemos el mismo principio a nuestros documentos y liberar nuestra creatividad para desarrollar nuevas y emocionantes formas de usar la literatura científica.

Para hacer realidad esta visión, necesitamos de su ayuda. Tenemos que presentar a su mejor obra a la revista y alentar a los colegas a hacer lo mismo. Más allá de eso, reconocemos que somos una única comunidad en la que utilizamos la información en nuevas formas. La revista en sí es sólo un caudal de información que pueden ser procesados y analizados. Tenemos nuestras propias ideas de lo que eso significa y cómo se puede cambiar la faz de la publicación, pero queremos su opinión también. Estos son tiempos emocionantes para la biología y la publicación. Esperamos sacar provecho de este entusiasmo, así que no dudes en decirnos lo que debemos hacer mediante el envío de e-mail a Ploscompbiol@plos.org.