Saline Systems, 2005; 1: 6-6 (más artículos en esta revista)

Examen de la "adaptación a la vida en altas concentraciones de sal en Archaea, Bacteria y Eukarya" Editado por Nina Gunde-Cimerman, Aharon Oren, y Ana Plemenitaš

BioMed Central
Christopher Rensing (rensingc@ag.arizona.edu) [1]
[1] Department of Soil, Water, and Environmental Science, University of Arizona, Tucson, AZ 85721, USA

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Resumen

La diversidad de ambientes hipersalinos y de la fisiología de los organismos representativos son sólo empezando a ser entendidos. Los recientes progresos en este ámbito está documentado en "La adaptación a la vida en altas concentraciones de sal en Archaea, Bacteria y Eukarya" - eds. Nina Gunde-Cimerman, Aharon Oren y Ana Plemenitas. Los 34 capítulos con éxito pintar un panorama fascinante que salen de estos entornos y los microorganismos que habitan en ellos.

A partir de una nueva revista on-line, tales como los sistemas de solución salina se presenta la oportunidad para que los editores y los posibles lectores se familiaricen con las recientes investigaciones en curso en este ámbito bastante amplio. ¿Qué mejor manera de empezar que con nuevas resumir los resultados y los desarrollos presentados en una bien atendidos y recibidos reunión científica? Esta es la idea detrás de "Las adaptaciones a la vida en altas concentraciones de sal en Archaea, Bacteria y Eukarya", que explora las muchas veces los aspectos de la vida bajo estas condiciones extremas. El libro fue iniciado en la conferencia internacional "Halophiles 2004" en Ljubljana, Eslovenia, en septiembre de 2004 organizada por Nina Gunde-Cimerman Plemenitas y Ana, una conferencia que se ha celebrado más o menos cada tres años desde 1978 (Fig. 1). La primera conferencia se celebró en Rehovot / Israel y organizada por Roy Caplan y Margaret Ginzburg. Una comparación de los temas tratados en las conferencias sobre los microorganismos halófilos hace veinte años y, más recientemente, refleja la rapidez con la materia se ha ampliado. Los 34 capítulos de captura actual de la amplitud de la materia y mostrar la versatilidad de estos microorganismos. Ambientes halófilos se extienden desde el Gran Lago Salado a la del Mar Muerto, sino también para entornos inesperados, como las regiones árticas, de aguas profundas hipersalinos salmueras hábitats y, posiblemente, en el espacio ultraterrestre. El estudio de los extremófilos también podría dar pistas para una mejor comprensión del origen de la vida aquí en la tierra, pero, posiblemente, también en otros lugares, por lo tanto, el vínculo a la exobiología explorado por Joseph Seckbach y Rocco Mancinelli en este volumen.

Si se da Oscars últimos años para los amantes de la sal, "Dos cuadrados off", sin duda, se lleva a casa el honor. En mi duda, y también la opinión de los medios de comunicación, el cultivo y la caracterización inicial de Walsby la plaza archaeon fue un logro importante. Henk Bolhuis' divertido para leer el artículo sin duda logra captar la fascinación de esta aparentemente extraña pero generalizada microbio. ¿Cómo se las arreglará para pasar por último un alto en 'Haloquadratum walsbyi', nada de fantasía, con el uso de agar agar en lugar de placas. Aparentemente simple, es ciertamente frustrante esconde muchas horas pasadas en el laboratorio. Otro éxito de la estrategia fue contratado por David Burns de Mike Dyall-Smith's laboratorio mediante la dilución en las culturas naturales saltern agua con unos pocos suplementos. Curiosamente, ambos lograron observar hojas grandes de Walsby del archaeon cuadrados, que mide aproximadamente 40 × 40 μ m. Si estas estructuras constituyen las células individuales, o se disuelven fácilmente en múltiples componentes cuadrados, en las condiciones utilizadas por D. Burns, este será sin duda un área de estudios futuros.

El estudio de las comunidades microbianas en el medio ambiente natural es de por sí difícil debido a los aspectos técnicos y biológicos. Una de las ventajas de los estudios de la ecología microbiana en ambientes extremos es la relativamente baja diversidad de las respectivas comunidades microbianas. Por tanto, no es de extrañar que esta invitación para estudiar la composición y la diversidad en los ambientes hipersalinos y fue seguida por una serie de científicos y los resultados de Great Salt Lake, el Mar Muerto, salterns en California y España y antiguos depósitos de sal resumen aquí. Además, a menudo descuidado depredadores como Haloviruses o protozoos se alimentan de las bacterias y de arqueas halófilas no sólo describe sino que también evalúa su impacto en las comunidades microbianas en tres capítulos.

La fisiología de los organismos halófilos y halotolerant también está cubierto en gran detalle y perspicacia en este volumen. ¿Cómo hacer esto, ¿cómo puede cualquier organismo sobrevivir en estas condiciones? Para sobrevivir y prosperar en un entorno hipersalinos, los microorganismos necesarios para desarrollar mecanismos de tolerancia osmoadaptation y sal. En la naturaleza, diferentes soluciones provocados por la evolución convergente a un entorno de baja actividad de agua se puede encontrar en diversos organismos capaces de soportar condiciones de alta sal. No sólo haloarchaea, como se pensó al principio, sino que también se acumulan bacterias internos de alta concentración de potasio y cloruro. Un importante, de relevancia ambiental representante, Salinibacter ruber, se describe en detalle desde una perspectiva ambiental y genómica. Otro aspecto sorprendente de la fisiología de algunos halophiles es su exigencia de cloruro. Una descripción más detallada se da en un interesante capítulo sobre el cloruro de exigencia moderada en bacterias halófilas por Volker Müller y Stefan Saum. Su hipótesis inicial de la necesidad de cloruro no es tan counterion como intuitivamente se podría creer, sino como un inductor de una novela de reglamentación red. Sin embargo, si eso fuera cierto, no esperar mutantes en la vía de señalización sin el requisito de cloruro?

Regulación transcripcional en haloarchaea También se describe el uso del gas de síntesis de vesículas como ejemplo. Es evidente que sólo a comienzos de la comprensión de la interacción entre gran parte inexplorado bacteriana-como represores y un eukaryae-como mecanismo de transcripción. Esta, creo, es una de las sorpresas de la reciente o en curso de la secuenciación del genoma esfuerzos. Brian Berquist y compañeros de trabajo proporcionan una amplia genoma-COG-basada en el inventario de los reguladores, la maquinaria transcripcional basal, y la replicación del ADN y la reparación de los sistemas en los dos completamente secuenciado haloarchaea, Halobacterium sp. NRC-1 y Haloarcula marismortui. Esto mostró casi todos los reguladores a ser bacteriana, junto con unos pocos (transferido lateralmente?) Componentes de la replicación del ADN y la reparación de los sistemas. Estos aspectos de la genética haloarchaeal es probable que sean objeto de un interés significativo en el futuro próximo.

Ana Plemenitas, Nina Cimerman Gunde-y sus respectivos miembros del grupo tienen que ser felicitados por sus esfuerzos hercúleos el establecimiento de las cosas sobre los hongos respuesta a baja actividad de agua y de su contribución y su impacto en los ambientes hipersalinos y en tres amplios y bien documentados capítulos.

Es un libro que vale la pena tener: por todos los medios SÍ! En general, contiene gran cantidad de información que sea realmente útil tener como recurso. Además, las estrategias de investigación y debates reflexivos se presentan en capítulos tales como la diversidad microbiana de Comunidades: El Caso de Solar Salterns por Carlos Pedros-Alio. Esta metodología es a menudo por lo menos tan importante como simples hechos y conclusiones, en especial para esperar el público destinatario de los alumnos de postgrado y los investigadores postdoctorales.