Immunome Research, 2005; 1: 1-1 (más artículos en esta revista)

Immunome Investigación

BioMed Central
Nikolai Petrovsky (nikolai.petrovsky @ flinders.edu.au) [1]
[1] Flinders Medical Centre/Flinders University, Bedford Park, Adelaide, 5042, Australia

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Resumen

Inmunología de investigación se ha transformado en la era post-genómica, con alto rendimiento de biología molecular y las tecnologías de la información tomando un papel cada vez más importante. Esto ha llevado al desarrollo de una nueva área de la ciencia denomina "Immunomics", que incluye genómica, la bioinformática y de alto rendimiento enfoques para inmunología. En reconocimiento de la creciente importancia de este campo, Immunome investigación es un nuevo acceso abierto, en línea revista, que publicará la investigación de vanguardia en todo el ámbito de la Immunomics. Immunome La investigación se publicará una amplia gama de tipos artículo especialidad inmunología incluidos bases de datos, base de datos de la inmunología Herramientas, immunome epítopo de investigación, herramientas de análisis de epítopo, tecnologías de alto rendimiento (la secuenciación de genes, microarrays, proteómica), white papers, matemáticos y modelos teóricos, y herramientas de predicción. Immunome La investigación es la publicación oficial de la Sociedad Internacional de Immunomics (IIMMS).

Introducción

El crecimiento explosivo de la biología molecular y tecnología de la información ha transformado radicalmente la inmunología en la investigación posterior a la era genómica. Idos están los días en que era posible hacer investigación de vanguardia inmunología sin el uso de herramientas moleculares o la capacidad de acceder y analizar datos desde múltiples, diversas bases de datos. Fertilización cruzada entre estas zonas ha dado lugar a todo un nuevo campo, llamado "Immunomics", que está configurado para transformar la manera en que se practica la investigación de la inmunología. Immunomics encuentra en la intersección de la tradicional 'wet lab' inmunología de investigación, tecnologías de alto rendimiento computacional y la inmunología. Computacional inmunología, o inmuno-la informática, extrae su origen de las zonas incluidas inmunología teóricos, modelos matemáticos, inteligencia artificial, gestión de bases de datos y herramientas de alineación de secuencias. La tradicional combinación de la inmunología con inmuno-informática, la biología de sistemas, de alto rendimiento molecular, la genómica y la proteómica tecnologías immunomics es lo que hace tan poderoso.

Dado el papel cada vez más importante de la investigación en inmunología immunomics, es oportuno que la primera revista dedicada a la investigación original en todo el ámbito de la immunomics está lanzado. Immunome investigación es un acceso abierto, en línea revista, que publicará la investigación de vanguardia en todo el campo De Immunomics. Immunome de Investigación de Investigación de la política de acceso abierto cambia la forma en la que los artículos son publicados. En primer lugar, todos los artículos y ser libremente accesible en línea tan pronto como se publiquen, a fin de la labor de un autor puede ser leído por cualquier persona, sin costo alguno. En segundo lugar, los autores tienen derechos de autor por su trabajo y conceder a nadie el derecho de reproducir y difundir el artículo, siempre que esté correctamente citado y no se introducen errores [1]. En tercer lugar, una copia del texto completo de cada artículo es de acceso abierto permanentemente archivados en un depósito en línea separada de la revista. Immunome de Investigación de Investigación de los artículos son archivados en PubMed Central [2], los EE.UU. Biblioteca Nacional de Medicina del texto completo repositorio de la vida Ciencia literatura, y también en los repositorios de la Universidad de Potsdam [3] en Alemania, en INIST [4] en Francia y en el e-Depot [5], la Biblioteca Nacional de los Países Bajos' archivo digital de todas las publicaciones electrónicas.

Open Access ha sido descrito como cuatro grandes beneficios para la ciencia y el público en general. En primer lugar, los autores están seguros de que su labor se difunda a la audiencia más amplia posible, en vista de que no existen barreras para acceder a su trabajo. Esto se acentúa por los autores están en libertad de reproducir y distribuir su trabajo, por ejemplo, mediante la puesta en la página web de su institución. Se ha sugerido que la línea gratis de artículos altamente citados son más debido a su fácil disponibilidad [6]. En segundo lugar, la información a disposición de los investigadores no será limitado por el presupuesto de su biblioteca, y la amplia disponibilidad de los artículos mejorará buscando literatura [7]. En tercer lugar, los resultados de investigaciones financiadas con fondos públicos sean accesibles para todos los contribuyentes y no sólo a los que tienen acceso a una biblioteca con una suscripción. Como tal, de acceso abierto puede ayudar a incrementar el interés del público en, y el apoyo de la investigación. En cuarto lugar, la economía de un país no influirá en sus científicos la capacidad para acceder a los artículos, porque los países de escasos recursos (y las instituciones) se puede leer el mismo material que las más ricas (aunque la creación de acceso a Internet es otro asunto [8]].

Antes de la puesta en marcha de Investigación Immunome no hay revistas especializadas que abarcan la nueva y rápida expansión, de dominio de immunomics. Anteriormente, los investigadores se vieron obligados a publicar sus immunomics investigación de la inmunología, ya sea en general o revistas de la bioinformática. Esas revistas no tienen fácil acceso a los encuestados con el conocimiento de expertos en todos los ámbitos de la inmunología experimental, de alto rendimiento y tecnologías de inmuno-informática. Además, los investigadores interesados en el área de immunomics no podía encontrar o tener acceso fácilmente a los documentos pertinentes, que fueron distribuidos en diferentes revistas.

Immunome La investigación es la publicación oficial de la Sociedad Internacional de Immunomics (IIMMS). IIMMS tiene un rápido crecimiento de miembros que ha expresado la necesidad de tener una revista especializada de alta calidad para proporcionar normas en el ámbito de la immunomics y proporcionar un punto focal para el crecimiento de esta zona. IIMMS ha establecido una serie de comisiones de trabajo, una función fundamental de la que será el desarrollo de libros blancos en sus zonas de concentración, con lo que crea un marco, la estructura y las normas para garantizar un rápido y constante crecimiento de estas áreas clave dentro de immunomics.

Immunome La investigación se publicará una amplia gama de tipos artículo especialidad inmunología incluidos bases de datos, herramientas de base de datos de la inmunología, immunome epítopo de investigación, herramientas de análisis de epítopo, tecnologías de alto rendimiento (la secuenciación de genes, microarrays, proteómica), white papers, matemáticos y modelos teóricos, y predicción Herramientas. Manuscritos de acuerdo con la revista del ámbito de aplicación pueden ser presentadas en línea a través del sitio web de la revista. Cada manuscrito será enviado a dos revisores independientes quien le entregará por escrito la información, e indicar si es o no aceptable para su publicación.

Las dificultades en el desarrollo y aplicación de herramientas computacionales inmunología incluyen la alta complejidad de los procesos inmunológicos, la imprecisión intrínseca de las mediciones biológicas, y las ideas erróneas y los prejuicios inherentes a la actividad científica. Hay que tener cuidado de que las herramientas computacionales son adecuados y que el modelo subyacente adecuadamente los procesos inmunológicos. Los prejuicios y conceptos erróneos que pueden ser fácilmente codificadas en herramientas computacionales resulta en una interpretación errónea de la información proporcionada por los enfoques computacionales. Una de las funciones de cálculo de la inmunología es convertir los problemas inmunológicos en computacional; resolver problema computacional usando métodos matemáticos y computacionales, y entonces podemos tratar de convertir estos resultados biológicamente significativos en la interpretación.

Herramientas bioinformáticas disponibles para la búsqueda en bases de datos y análisis de secuencias biológicas se han convertido en cada vez más sofisticados. Estas herramientas permiten identificar rápidamente las secuencias de interés, y proporcionar algunos bibliográficos, la información taxonómica y de la característica. Herramientas para la secuencia de comparación, el motivo de la búsqueda, o una secuencia de perfiles de ayudar a los investigadores a determinar biológicamente relevantes secuencia similitudes y características. Una nueva generación de herramientas computacionales permite la modelización de las interacciones biológicas y simulación de experimentos de laboratorio. Estas herramientas ayudan a los investigadores a identificar y centrarse en los experimentos, por lo tanto, acelerar el proceso de detección. Biológica bases de datos, herramientas de comparación de secuencias, y más complejos instrumentos de modelización y simulación de los recursos básicos, por lo tanto, con ayuda de computadora para el descubrimiento y análisis de datos. Al proporcionar un foro para la publicación de artículos científicos en todo el amplio dominio de immunomics, Immunome de investigación aspira a convertirse en un valioso recurso para toda la comunidad de investigación inmunología.